El «VR Disc» de la versión Integral fue lanzado como producto independiente fuera de Japón, en América del Norte como Metal Gear Solid: VR Missions el 23 de septiembre de 1999,​ y en Europa como Metal Gear Solid: Special Missions el 29 de octubre de 1999. Al cargar las misiones especiales, se le pide al jugador que reemplace el disco del juego con cualquiera de los discos del Metal Gear Solid. Si el disco está correctamente identificado, el jugador puede insertar el disco de las misiones especiales y el juego se carga con normalidad. Este requisito se ausentó en las versiones americanas y japonesas de VR Missions. Una versión para PC de Integral también fue lanzado en Europa y América del Norte a finales del 2000, bajó la PocketStation. Con una evaluación de 83/100 de Metacritic, el juego fue criticado por «problemas gráficos» y debido a que esencialmente es una versión idéntica a la de PlayStation.​